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Inhibiteurs peptidomimétiques

Les interactions protéine-protéine (IPP) étant impliquées dans de nombreux processus physiopathologiques, la recherche d’inhibiteurs d’IPP est une stratégie prometteuse mais difficile dans la conception de médicaments. Au sein de l’équipe FLUOPEPIT, le groupe de modélisation moléculaire développe et applique des méthodes computationnelles pour concevoir et étudier des peptides et des peptidomimétiques qui (i) seraient susceptibles de se lier à une interface protéine-protéine ciblée avec une haute affinité et (ii) auraient une bonne stabilité protéolytique et une bonne perméabilité membranaire. Notre stratégie à cet effet est une approche basée sur les fragments qui identifie les séquences optimales de peptides cycliques pour la liaison d’une surface protéique spécifique. En outre, nous utilisons des simulations de dynamique moléculaire améliorées pour caractériser les ensembles conformationnels de divers peptidomimétiques (cycliques, fluorés, aza...) et leur perméabilité membranaire.