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Les alcools fluorés, trifluoroéthanol (TFE) et hexafluoroisopropanol (HFIP) possèdent des propriétés particulières (acidité, polarité, haut pouvoir donneur de liaison Hydrogène, …), et permettent donc de réaliser des réactions propres et sélectives sans promoteur supplémentaires (acide de Lewis ou de Brönsted).
Le fluor est devenu un outil fondamental dans le développement de médicaments. Les composés trifluorométhylés sont particulièrement importants, comme en témoigne le nombre de médicaments et candidats-médicaments contenant du CF3 utilisés en clinique ou en développement.